methylation是什么意思,methylation中文翻譯,methylation發(fā)音、用法及例句
?methylation
methylation發(fā)音
英:[meθ?'le??n] 美:[meθ?'le??n]
英: 美:
methylation中文意思翻譯
n. 甲基化作用
methylation常見例句
1 、Acetic acid methyl amyl ester.───乙酸甲基戊酯。
2 、One kind of methylation alteration is that the unmethylated CCGG sequence was transformed into external hemimethylated cytosines.───一類變異是將未甲基化CCGG位點的外側(cè)胞嘧啶半甲基化,此類變異基本上不能傳遞給再生苗;
3 、Methylation status of E-cad in 60 primary ACC was also examined by the same method.───同法從60例ACC 組織切片中刮取腫瘤細胞,檢測E-cad 基因甲基化狀況。
4 、But what happens if the methyl defense falters?───如果說這種甲基防御出了問題,又會發(fā)生什么事呢?
5 、The investigation on the role of DNA methylation in carcinogenesis have been mainly focused on promoter hypermethylation of tumor suppressor genes.───關于DNA甲基化在腫瘤中的作用的研究,大多集中在研究已知的抑癌基因啟動子區(qū)的異常高甲基化。
6 、Aberrant DNA methylation reinforce the gastrical tumorigenesis by promoting gene mutation and enhancing the chromatosome instability ,etc.───DNA的異常甲基化通過影響基因轉(zhuǎn)錄,促基因突變,增加染色體結構的不穩(wěn)定性等多方面促進胃癌的發(fā)生發(fā)展。
7 、To combine with the methyl radical.───使甲基化使與甲基根結合
8 、Decitabine is the most common medicament used to reduce the level of methylation.───地西他濱是用于降低甲基化的常用藥物。
9 、The abnormality of DNA methylation includes global hypomethylation and region-specific hypermethylation.───DNA甲基化異常包括全基因組的低甲基化和局部基因的高甲基化。
10 、CRL was reacted much more quickly with methyl 5-N-(2, 6-xylyl)-alanate than that with R isomer.───CRL脂酶對S-(-)-N-(2,6-二甲苯基)-丙氨酸甲酯作用速度遠大于R-(+)-異構體。
11 、Methylation within the NF2 promoter region was only identified at a single CpG site in one tumor sample.───NF2啟動子區(qū)域甲基化只在一例腫瘤樣品中單個CpG位點中檢測到。
12 、P15 gene methylation might be related with the pathogenesis, and prognosis of MM.───p15基因甲基化可能是MM發(fā)病的原因之一,與MM的發(fā)展及預后有一定的關系。
13 、The bis(S)-Naproxen methyl ester is(+)-enantiomer.───對其代謝過程作了初步探討。
14 、The conformational change of M. L. DNA with different methylation level was measured by CDD and UVD spectra.───L. DNA分離出來.
15 、The applications of methyl trichlorosilane in the preparation of the.───一甲基三氯硅烷。
16 、I identified trace amounts of methyl aldehyde in the delivery system, aka formaldehyde.─── 我在緩釋系統(tǒng)中發(fā)現(xiàn)了 少量的甲醛 也就是福爾馬林
17 、Abnormal DNA methylation can influence the expression of certain genes,inducing occurrence and development in autoimmune diseases.───DNA甲基化異??捎绊懩承┗虻谋磉_,導致自身免疫性疾病的發(fā)生發(fā)展。
18 、Such as Vincristine Sulfate, Vinorelbine Bitartrate, NHDC and Hesperidin Methyl Chalcone.───例如硫酸長春新堿、酒石酸長春瑞憲,NHDC。
19 、The methylation specific PCR (MSP) and bisulfite DNA sequencing were performed to examine the methylation status of SLIT2 gene promoter.───亞硫酸氫鈉處理DNA,用MSP和測序法檢測SLIT2啟動子甲基化狀態(tài)。
20 、Recent studies on DNA methylation and its regulatory enzymes,seem hot to researches of epigenetics.───DNA甲基化及其調(diào)節(jié)酶是近年來表觀遺傳學研究的熱點。
21 、A total of 74.6 kilograms of methyl amphetamine or 'ice' was seized in 1997, compared with 46.8 kilograms in 1996.───在一九九七年,共檢獲74.6公斤氧麻黃堿(或稱"冰"),而在一九九六年則檢獲46.8公斤。
22 、In TGS in plants, cytoplasmic dsRNA containing promoter sequences is able to direct the silencing, and de novo methylation, of the homologous DNA.───在TGS的植物中,細胞質(zhì)的雙鏈RNA含有啟動子序列,是能夠直接沉默,和去甲基化,同源的DNA 。
23 、As expected, tumor cells showed the highest methylation leels.───如所預料的一樣,腫瘤細胞呈高度甲基化。
24 、Thus the term dialkyl carbonate includes, for example, methyl ethyl carbonate.───因此術語二烷基碳酸酯包括,例如甲基乙基碳酸酯。
25 、Suppose you add a brief pulse of [3-14C] pyruvate (labeled in the methyl position) to the mitochondria.───假設你向線粒體中加入一個[3-14C]的丙酮酸(標記在甲基上)的短的脈沖。
26 、Su(ar)3-9 proteins attach methyl groups to the histone labeled H3 at its ninth amino acid residue, which is a lysine.───9蛋白將甲基加在組蛋白H3的第九位氨基酸殘基,也就是賴氨酸殘基上,從而使H3組蛋白貼上了個標簽。
27 、Methylation of TMS1/ASC gene in promotor region is related with the genesis of ovarian carcinoma.───TMS1/ASC基因啟動子甲基化與卵巢癌發(fā)生的關系
28 、The group now aims to map the methylation patterns in 200 samples representing the entire human genome and all the major human tissues.───小組現(xiàn)在打算在代表整個的人類基因組和所有的主要人類組織的200個樣本中,來描繪映射甲基化型態(tài)。
29 、Z associates with functional regulatory elements, and CTCF marks boundaries of histone methylation domains.───Z和功能調(diào)控元件相關,CTCF標記組蛋白甲基化區(qū)域邊界。
30 、The mechanism of methylation reaction is discussed.───對甲基化反應機理進行了討論.
31 、Various overlay mediums, such as agar, starch gel, methyl cellulose and tragacanth are used.───常用的覆蓋培養(yǎng)基有:瓊脂、淀粉凝膠甲基纖維素和黃蓍膠等。
32 、Some methods could also determine the pattern of methylation or the degree of pectins acetylation.───其中有些方法可以同時測定果膠的甲酯的取代方式或**化取代度。
33 、Methylation of hMSH2 gene promoter CpG islands was not detected in gastric carcinoma or normal tissues.───hMSH2基因啟動子CpG島在胃癌及正常組織中均未檢測到甲基化。
34 、Methods Methylation status of RASSF1A promoter was detected by MSP in 40 cases of breast cancer tissues and 24 cases of matched benign tissues.───因此認為RASSF1A基因的失活可能與腫瘤的發(fā)生有關。
35 、For example: Heavy lead, fusel oil, formaldehyde, methyl alcohol and so on.───如:重鉛、雜醇油、甲醛、甲醇等。
36 、After fusion of cytoplasm, the DNA methylation levels of the fused embryos was very high as well as two-cell diploid embryos in vivo.───在細胞核開始融合的時候,甲基化水平急速下降,在細胞核完全融合的時候甲基化水平達到最低點;
37 、They found fresh dirt on the tires with traces of arsenic, lead and methyl chloride.─── 輪胎上有新鮮泥土 其中含有砷 鉛 還有氯甲烷
38 、Cases with methylation of COX-2 and hMLH1 gene promoter CpG islands in gastric carcinoma were 8 and 13, and they were not detected in normal tissues.───COX-2和hMLH1基因啟動子CpG島甲基化在43例胃癌中分別有8例和13例,正常組織中未檢測到。
39 、Methylation of hMLH1 and COX-2 gene promoter CpG islands may both occur in the development of MSI gastric carcinoma.───在MSI胃癌(尤其是MSI-H型胃癌)的發(fā)生、發(fā)展過程中可能同時出現(xiàn)了hMLH1和COX-2基因啟動子CpG島的甲基化(即表型遺傳修飾)。
40 、Decreased RASGRF2 expression was presented in 36% (5/14) lung cancer cell lines while aberrant methylation of RASGRF2 was present in 29% (4/14) lung cancer cell lines.───RASGRF2 在 36% (5/14)的肺癌細胞中表達降低,而在 29% (4/14) 肺癌細胞中存在異常甲基化。
41 、CpG Methylation and Gene Regulation and Gene Regulation.───CpG甲基化與基因調(diào)控。
42 、It's rare around here, and I believe the methyl in the superglue ignited this rash.─── 在這兒很稀少 我覺得是強力膠引起了這些紅疹
43 、But another group was fed chow enriched with vitamin B12, folic acid and other good sources of methyl.───將**的橙腰鼠,一組喂食普通的飼料,其子代有60%出**的毛發(fā)。
44 、The characteristics of DOT1 proteins and H3K79 methylation suggest that they may have important and characteristic functions.───DOT1及H3K79甲基化的特點決定了其可能具有重要的、特殊的生物學功能。
45 、The methylation rate of hMLH1 gene promoter CpG islands in MSI-H was higher than that in MSS (P───在MSI-H組hMLH1基因啟動子CpG島甲基化率顯著高于MSS組(P
46 、The cream contains escin, hesperidine, methyl chalcone and coenzyme Q10.───乳液包含包含七葉皂素、橙皮苷、甲基酮和Q10。
47 、Produced from lauryl alcohol and methyl laurate.───以硬酯醇及甲基棕櫚。
48 、At first, ?I thought it was alien radiation markers I've never seen, foreign methyl groups.─── 一開始我以為是什么外星人 上面有我從沒見過的輻射標記 還有外來的甲基原子團
49 、When the H3K9 methylation pathway is functioning properly, heterochromatin remains condensed and a single nucleolus forms around the ribosomal DNA.───當H3K9甲基化路徑正常是,異染色質(zhì)處于致密狀態(tài),在核糖體DNA周圍形成單個核仁。
50 、The concordance between loss of expression and aberrant methylation of RASGRF2 was 86% (12/14) in cell lines.───RASGRF2 在肺癌細胞表達降低和異常甲基化的吻合率為86% (12/14);
51 、DNA methylation is a kind of normal endogenous modified mode,which is fulfilled by DNA methylation transferase.───DNA甲基化是真核生物DNA的正常內(nèi)源性修飾方式,它由DNA甲基化轉(zhuǎn)移酶催化發(fā)生。
52 、Methyl silicone oil polysulfonate drilling fluid.───產(chǎn)。甲基硅油聚磺高密度鉆井液。
53 、ACR is a copolymer of methyl methacrylate with acrylate.───ACR是一種甲基丙烯酸甲酯與丙烯酸酯類的共聚物。
54 、The frequency of p16 promoter methylation is higher in Dukes stages of C and D CRC (59%) than A and B CRC (20%)(p───p16基因啟動子區(qū)甲基化在Dukes分期A、B和C、D期中發(fā)生率分別為20%和59%,差異顯著(p
55 、We will further investigate the relationship of histone modification and promoter methylation on the expression of TFPI-2.───今后,我們將在表觀遺傳層面對TFPI-2基因的修飾和相關組蛋白的修飾進行深入研究。
56 、The genomic DNA methylation tends to repress gene expression while demethylation or hypomethylation activates the gene expression.───基因組DNA的甲基化修飾通常使基因轉(zhuǎn)錄失活,去甲基化或低甲基化則使基因轉(zhuǎn)錄活化。
57 、DNA methylation has also been found in premalignant lesions such as prostatic intraepithelial neoplasia, but to a less extent compared with that in prostate cancer.───前列腺癌前病變?nèi)缜傲邢偕掀?nèi)瘤也存在DNA甲基化,但程度相對較低。
58 、Genes are imprinted by the addition of molecules called methyl groups to the gene's DNA.───基因印跡是通過在基因的DNA上鏈接附加的甲基團(一種分子的名稱)達成的。
59 、An organic compound, especially ethane, containing two methyl groups.───雙甲基的,乙烷一種有機化合物,特別是乙烷,內(nèi)含有兩個甲基
60 、Methyl ethyl ketone. It's a solvent.─── 甲基乙基酮 是一種溶劑
61 、The other, called L-methionine, is a donor of methyl groups.───另一個是L-甲硫氨酸,它可以提供甲基。
62 、Just a scruffy white drifter who *elled like methylated spirits.─── 也只不過是個臟兮兮一身酒臭味的流浪漢罷了
63 、You were the cutout, you deliver the boat, he shoots you, and 300 gallons of burning methyl chloride cleans up the mess.─── 你來當替死鬼 把船送到 然后他給你一** 300加侖燃燒的氯甲烷就能毀尸滅跡
64 、Aberrant methylation of DNA has been recognized as common epigenetic changes in human cancer.───DNA異常甲基化是腫瘤常見的表觀遺傳學改變。
65 、The yield of dimethoxy methyl aceto acetate can be reached 55.3 %.───二甲氧基**乙酸甲酯的收率可達53.3%。
66 、DNA methylation has an important role in transcriptional regulation, togethering with histone modification and chromatin remodeling.───DNA甲基化在基因轉(zhuǎn)錄過程中扮有重要角色,并與組蛋白修飾、染色質(zhì)構型重塑共同參與轉(zhuǎn)錄調(diào)控。
67 、TMV CP;different constructs;methylation;post transcriptional gene silencing;watermelon;virus diseases;transformation;resistance.───不同結構形式;甲基化;轉(zhuǎn)錄后基因沉默;西瓜病毒病;轉(zhuǎn)基因;抗病性
68 、A polysaccharide of unknown structure was isolated, subjected to exhaustive methylation, and hydrolyzed.───一未知結構的多糖,經(jīng)完全甲基化和水解。
69 、We found that purified MPH have a 20-fold higher hydrolytic efficiency to methyl parathion than to parathion.───對MPH純酶的底物特異性研究中發(fā)現(xiàn):它水解甲基對硫**的比活力是水解乙基對硫**比活力的20余倍。
70 、Various overlay mediums, such as agar, starchgel, methyl cellulose and tragacanth are used.───常用的覆蓋培養(yǎng)基有:瓊脂、淀粉凝膠甲基纖維素和黃蓍膠等。
71 、So the DNA methylation patterns of mouse tetraploid embryos are aberrant, which may lead to subsequent de-velopmental failure and embryo death.───因此, 小鼠體外培養(yǎng)四倍體胚胎的甲基化模式是不正常的, 這可能是四倍體小鼠難以發(fā)育到妊娠足月的原因之一。
72 、Produced from stearyl alcohol and methyl behenate.───可按客戶要求生產(chǎn)。
73 、Produced from stearyl alcohol and methyl palmitate.───以硬酯醇及甲基二十二。
74 、In this case, methyl alcohol will be excreted unmetabolized in the urine.───在這種情況下,甲醇將以原形隨尿排除。
75 、DNA methylation is an important epigenetic modification of the mammalian genome that regulates gene expression and chromatin organization.───DNA甲基化是對哺乳動物基因組一種重要的表觀遺傳修飾,調(diào)控著基因表達和染色質(zhì)組織結構。
76 、CFTR and GSTP1, have aberrant high methylation profiles in HCC by contrast with the unmethylated normal controls.───CFTR基因和GSTP1基因在正常肝組織中均未甲基化,而在癌旁組織和癌組織中甲基化比例較高。
77 、The kinetics of graft copolymerization of SBS and methyl methacrylate in toluene initiated by BPO was investigated.───以過氧化苯甲酰(BPO)為引發(fā)劑,甲苯為溶劑,膨脹計法研究甲基丙烯酸甲酯與SBS接枝聚合反應動力學。
78 、Pseudomonas putida DLL-1 is a high effective methyl parathion(MP) degrading strain,which is also of chemotaxis to MP.───Pseudomonas putida DLL-1是一株甲基對硫**(MP)高效降解菌株,同時對MP具有趨化性。
79 、In the development of leukemia, methylation plays an important role in the genetic expression regulation and genetic structure stabilization.───在白血病的發(fā)展中,甲基化對基因表達的調(diào)控和基因結構的穩(wěn)定起著重要的作用。
80 、DNA methylation plays a key role in transgene silencing.───DNA甲基化是引起外源基因沉默的主要原因。
81 、Methanol, ethanol and glycolic methyl ether as precursor solvent of boric acid.───對上述體系中不同的先驅(qū)體及溶劑進行交叉實驗。
82 、DNA methylation and its aberrance play an important role in the human development and tumorigenesis.───DNA的甲基化及甲基化異常在人體發(fā)育和腫瘤的發(fā)生中起著至關重要的作用。
83 、In benzene or ethyl acetate solution rates increase linearly with methyl methacrylate concentration.───在苯或乙酸乙酯溶液中其衰減速度隨甲基丙烯酸甲脂濃度呈直線地增大。
84 、The working solution is made by mixing 1 part of the stock solution with 6 to 8 parts of methyl alcohol.───工作用液是1份儲備液和6-8份甲醇配成的。
85 、Our data show that 5 aza CdR may inhibit tumor growth by reactivating growth regulatory genes silenced by de novo methylation.───5 aza CdR有肯定的抑瘤作用 ,其抑瘤作用的可能機理主要是通過p16基因去甲基化解除轉(zhuǎn)錄抑制完成的。
86 、Allene is an isomer of methyl acetylene.───丙二烯是甲基乙炔的一種異構體。
87 、Alterations in DNA methylation, an important regulator of gene transcription, lead to cancer.───對調(diào)節(jié)基因轉(zhuǎn)錄起重要作用的DNA甲基化的異常將導致癌癥的發(fā)生。
組蛋白甲基化修飾(Histone Lysine Methylation)
染色質(zhì)的精細調(diào)色板:組蛋白甲基化的作用與動態(tài)平衡
在真核生物的基因舞臺上,組蛋白甲基化(組蛋白H3和H4的N端尾部的賴氨酸或精氨酸被甲基化修飾),這一過程由組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶(HMTs)精細操控,如同藝術家手中的畫筆,將S-腺苷甲硫氨酸(SAM)的甲基巧妙地添加到DNA的守護者上。賴氨酸可接納一至三個甲基,精氨酸則可被加上一或兩個,這些看似微小的變化,卻在基因表達的調(diào)色板上產(chǎn)生了深遠影響。
核小體的動態(tài)核心
作為染色質(zhì)的基本組件,核小體由H3-H4和H2A-H2B二聚體構成,最初被認為是DNA的靜態(tài)框架。然而,現(xiàn)代研究揭示,組蛋白并非靜止不變,它們通過甲基化等翻譯后修飾,參與到細胞核的多種功能調(diào)控中,尤其是賴氨酸甲基化,成為決定基因組結構和活性的關鍵開關。
賴氨酸甲基化:三種狀態(tài)與命運決定
賴氨酸的甲基化狀態(tài)——單、二、三甲基化,如同基因組的密碼,與不同的核活性和轉(zhuǎn)錄狀態(tài)緊密相連。通過賴氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(KMTs)的精細操作和去甲基化酶(KDMs)的調(diào)節(jié),這些變化在細胞層面刻畫了基因的開啟與關閉。
抗癌策略的基石:組蛋白去甲基化酶
其中,一些去甲基化酶,如KDM2/7,擁有抗癌潛力,它們抑制了過度的甲基化,恢復基因的正常表達。HMTs和KDMs的特異性識別和作用,共同構建了染色質(zhì)調(diào)控的精密網(wǎng)絡。
組蛋白甲基化:基因表達的指揮棒
甲基化程度和位置決定了基因的轉(zhuǎn)錄命運。H3K4me2、me3和H3K79me3傾向于激活,而H3K9me2、me3、H3K27me2、me3和H4K20me3則抑制,它們還參與DNA修復,與相關蛋白形成動態(tài)協(xié)作。
賴氨酸甲基化在性別決定與疾病中的角色
在雌性哺乳動物中,X染色體的去活化過程中,組蛋白H3K9me3、H3K27me3等位點的甲基化至關重要,它們通過與Xist RNA的結合,將X染色體塑造成異染色質(zhì),這一過程的失調(diào)與多種癌癥的發(fā)展緊密相關。
通過深入理解組蛋白甲基化這一生物化學機制,我們得以窺探生命的復雜性,揭示基因表達調(diào)控的深層邏輯。賴氨酸甲基化,這一看似微不足道的修飾,實則在細胞的每一絲基因活動背后發(fā)揮著至關重要的角色。
人類早期胚胎發(fā)育DNA甲基化景
人類早期胚胎發(fā)育DNA甲基化圖景——表觀遺傳學—胚胎發(fā)育系列第1篇
DNA甲基化是一種重要的表觀遺傳修飾在基因轉(zhuǎn)錄表達、基因印記的維持、X染色體失活和轉(zhuǎn)座子元件的表達等一系列生物學過程中扮演重要的角色。
哺乳動物中最具有戲劇性的表觀組變化發(fā)生在原始生殖細胞和胚胎植入前的發(fā)育過程。
為了獲取人類早期胚胎的DNA甲基化圖譜,作者使用全基因組簡化甲基化測序(RRBS)和全基因組甲基化測序(WGBS)技術對人類配子和植入前后的 胚胎進行了研究。
本研究使用的材料如下:
使用的材料為極體(polar body)、成熟卵母細胞(oocytes)和第一極體、合子(zygotes)、 2細胞、4細胞、8細胞、桑椹胚(morula)、內(nèi)細胞團(inner cell mass,ICM)和囊胚階段的滋養(yǎng)層細胞(trophectoderm cells,TE),此外還有精細胞。
不同類型細胞的DNA甲基化水平聚類顯示,不同類型細胞間有各自獨特的甲基化特征。
例如:極體和卵母細間的甲基化狀態(tài)相似,而與其他類型細胞差別較大;精細胞甲基化狀態(tài)與其他類型細胞有明顯的區(qū)別;2細胞-TE發(fā)育過程中甲基化狀態(tài)變化比較平穩(wěn)。
在基因體(gene body)層面和不同發(fā)育階段層面,不同類型、發(fā)育時期細胞的甲基化轉(zhuǎn)態(tài)變化明顯。
小鼠中甲基化擦除主要發(fā)生在合子-2細胞過程,而人類胚胎發(fā)育中去甲基化和甲基化重建又有什么特點呢?不同的基因組區(qū)域的甲基化水平變化是否同步?
對不同CpG含量的啟動子(HCP、ICP、LCP)、CpG島(CGI)、外顯子(Exon)、內(nèi)含子(Intron)、基因(Intragenic)、基因間區(qū)(Intergenic)、轉(zhuǎn)座子元件(細分為SINE、LINE、LTR)和增強子(Enhancer)的甲基化水平進行計算,繪制動態(tài)發(fā)育過程甲基化水平的變化。
結果發(fā)現(xiàn),整體上不同基因組區(qū)域的甲基化動態(tài)變化相似,說明胚胎發(fā)育過程中全基因組的甲基化變化趨勢一致,是一個統(tǒng)一的過程。但也能發(fā)現(xiàn)高CpG的區(qū)域如CGI和HCP一直是去甲基化狀態(tài)且甲基化水平相對穩(wěn)定。
此外,對第1極體和第2極體的甲基化水平進行比較,二者從卵母細胞取出的過程是對甲基化狀態(tài)產(chǎn)生了影響以及二者是否本身就存在較大的甲基化水平的差異。
結果發(fā)現(xiàn),第1、2極體和卵母細胞的甲基化水平差別不大,說明從卵母細胞中擠壓出極體的過程中沒有產(chǎn)生全基因組甲基化的非對稱性。
有文獻報道小鼠中卵母細胞中non-CpG的DNA甲基化水平,而人類卵母細胞尚未有相關報道。
繪制gene body側(cè)翼non-CpG甲基化曲線發(fā)現(xiàn),non-CpG甲基化水平較低,gene body的甲基化水平明顯高于側(cè)翼,且整體分布形態(tài)和CpG甲基化模式相似。
不同類型胞嘧啶的甲基化水平存在差異那么,DNA甲基化水平和胞嘧啶的密度是否存在關系?
胚胎發(fā)育過程中甲基化發(fā)生了劇烈的變化,那么去甲基化的過程中父源和母源基因組的甲基化動態(tài)如何呢?
使用單細胞RRBS技術對分離出的父源、母源的原核進行測序,并分析了DNA甲基化水平的動態(tài)變化。
可見,父源和母源的原核的甲基化動態(tài)變化非常的劇烈且并不一致。配子階段精細胞甲基化水平較卵母細胞稍高,顯微注射后的數(shù)十個小時里發(fā)生了較大的變化,父源和母源原核甲基化水平迅速下降,父源的去甲基化程度更大,最終父源的甲基化水平比母源的要低形成反轉(zhuǎn),免疫熒光染色也證實了這一點。
接下來,對精細胞和卵母細胞的甲基化相似性和差異性進行了分析。使用固定長度區(qū)域(100bp)來計算全基因組的tile甲基化水平,并分別對高甲基化(≥75%)和低甲基化(≤25%)區(qū)域進行分析。
分析高甲基化和低甲基化區(qū)域的分布特點發(fā)現(xiàn),高甲基化區(qū)域顯著富集于SINE和LINE等轉(zhuǎn)座子元件,用于抑制轉(zhuǎn)座元件的轉(zhuǎn)錄活性。而低甲基化區(qū)域富集于HCP、增強子、外顯子和CpG島,用于維持胚胎發(fā)育。
此外,還對卵母細胞和精細胞間的差異甲基化區(qū)域(differentially methylated regions,DMR)進行了研究,分別鑒定出了17,473個精細胞特異的DMRs和12,145個卵母細胞特異的DMRs。
接下來,對DNA甲基化與組蛋白修飾間的關系進行了探討。
結果發(fā)現(xiàn),胚胎干細胞和ICM階段H3K27me3區(qū)域通常富含低水平的DNA甲基化,配子和中間的發(fā)育階段同樣存在低甲基化的現(xiàn)象。
隨后,對基因表達和DNA甲基化間的關系進行探討。
分別對基因體和啟動子的甲基化水平與基因表達量間的相關性進行了計算,結果發(fā)現(xiàn),基因和啟動子的 甲基化水平與基因的表達量呈負相關的關系,且發(fā)育后期的負相關性越來越高。這說明,在DNA甲基化的擦除和重建的各個階段,啟動子的DNA甲基化仍然會抑制相關基因的表達。
最后,對DNA甲基化是如何抑制轉(zhuǎn)座子元件的機制進行了探討。以常見的長散在重復序列(LINE)和短散在重復序列(SINE)進行了探討。
在不同發(fā)育階段,重復元件的表達與DNA甲基化的區(qū)域呈現(xiàn)負相關。胚胎發(fā)育早期DNA甲基化被擦除,重復元件的表達水平提升,后期DNA甲基化水平重建重復元件的表達水平被強烈抑制,維持較低的水平(圖a,c)。此外,Alu、MIR、L1和L2的平均甲基化水平符合全基因組甲基化水平的變化。
本文對人類早期胚胎不同發(fā)育階段樣本的DNA甲基化水平進行了探討,對DNA甲基化、組蛋白修飾、基因表達和轉(zhuǎn)座子元件間的關系進行了研究。
人類早期胚胎發(fā)育的各個階段全基因組的甲基化水平發(fā)生了劇烈的變化,發(fā)生了從去甲基化到甲基化重建的過程;不同發(fā)育階段的細胞有其特有的差異甲基化區(qū)域;DNA甲基化與不類型的組蛋白修飾有完全不同的相關性,說DNA甲基化和不同類型的組蛋白修飾各自調(diào)控著一套基因集;轉(zhuǎn)座子元件和DNA甲基化關系也十分密切,同樣經(jīng)歷了擦除和重建的過程;另外,DNA甲基化的狀態(tài)同時影響了基因的表達,尤其是發(fā)育后期啟動子區(qū)域的甲基化與基因表達的負相關性明顯增強。
總之,該文系統(tǒng)的研究了人類早期胚胎發(fā)育不同階段的DNA甲基化情況,首次展示了人類早期胚胎的表觀圖景,為以后深入研究胚胎發(fā)育機制奠定了基礎。
The DNA methylation landscape of human early embryos. NATURE. 2014. doi:10.1038/nature13544
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